次世代シーケンシング
インプランタでは全ゲノムde novoシーケンス解析、全ゲノムリシーケンス解析をはじめとして、目的に応じた次世代シーケンシングメニューをご用意しています。
植物試料からのゲノムDNA抽出及び品質チェックも承っております。
下記のサービスフローをご参照ください。
全ゲノムde novoシーケンス解析
これまでにリファレンスシーケンスのない、未知のゲノム解析を行います。
シーケンスプラットフォームとシーケンスリード長、ペア-エンド 及びメイト-エンドライブラリーオプションとの組み合わせにより、様々な生物の全ゲノム解析を可能にします。植物ではシロイヌナズナ、ビーツ、ゴムの木、パルムオイル、ブドウ、野菜類等、豊富な経験があります。微生物ゲノムの解析も承っております。
●使用可能なプラットフォーム
Illumina HiSeq2000 / HiSeq2500 / MiSeq
●Data Analysis
De novo Assembly
Gene Prediction
Variant Calling (SNP, In/Dels)
Gene Annotation
Customized Analysis
全ゲノムリシーケンス解析
既にリファレンスシーケンスのあるものについて全ゲノムリシーケンス解析を行います。
変異体の解析、２つの品種間の比較、遺伝子マッピング等に、幅広くご利用いただけます。SNP解析等データ解析も承っております。
●使用可能なプラットフォーム
Illumina HiSeq2000 / HiSeq2500 / MiSeq
●Data Analysis
Alignment and summary of data production
Variant Calling (SNP, In/Del) and Annotation
Structural Variation (CNV and SV) and Annotation
Comparative Analysis
Customized Analysis
サービスフロー
(青色がお客様の作業になります)
ご依頼内容の打ち合わせ
*御見積やサンプル情報をご連絡いたします
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ご発注
gDNAをご送付の場合
gDNAの抽出から弊社が行う場合
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サンプル及び
オーダーシートをお送りください
まずはsmall-scaleで収量等の
確認を行います
試験用のサンプルをご提供ください
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small-scaleで抽出、収量の確認
small-scaleでの結果から必要サンプル量等をご相談させていただきます
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本サンプルをご提供ください
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large-scaleで必要量の抽出
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サンプルの品質確認
*gDNAをご送付頂いた場合の品質確認は3回まで無料で行います
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品質確認レポートのご報告
*品質確認の結果から、解析に進めるかをご相談させていただきます
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解析開始
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解析結果の納品
標本作製
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